在实现世界性非武装化的2007年，如超古代文明人幽怜所预言:二大怪兽“哥尔赞”及“美尔巴”出现了。在怪兽攻击的目标——金字塔内，发现了三座巨大的石像。其中两座巨像被怪兽摧毁了。在这紧要关头，有着超古代人遗传因子，属于地球和平…

由于大彗星接近地球，导致地壳产生剧烈变动，使得残存于地底下的恐龙族群再度出现于地表之上。但是不稳定的气候突变与充满野心的盗猎者，却让这些重见天日的恐龙们再度面临灭绝的处境；为了保护这些野生的恐龙，“国际自然保护联盟”特地…

故事開始前的十年前，在天才科學家基奧羅古（ゲオルク·ララーシュタイン）處，學習機器人工學的嵐田陽一郎，知道了基奧羅古征服世界的野心，於是自己炸毀了完成的馬赫男爵後離去，後與妻子一起被殺害。陽一郎在死前把馬赫男爵的設計圖交…

将《奥特Q》直到《爱迪奥特曼》的怪兽与奥特曼的名战斗场面集然后再追加编集的剧场版作品，由奥特曼兄弟的老大·佐菲负责解说。本作有36只大怪兽登场。